根据提供的信息，部队社保的管理主要由以下部门负责：1. 中国人民解放军总后勤部：负责军人保险信息系统的建设，并对军人保险基金的收支和管理情况进行监督。2. 军队后勤（联勤）机关财务部门：负责承办军人保险登记、个人权益记录、军人保险待遇支付等工作，并与地方社会保险经办机构协作办理军人保险与社会保险关系
